jueves, 5 de noviembre de 2009

El genoma humano en 3D, un principio de existencia...

Desplegado, el genoma humano tendría unos seis pies de ADN. Sorprendentemente, todo ese largo está enrollado en el núcleo de una célula de unos tres micrómetros de diámetro; aproximadamente, un tercio del ancho de un cabello humano.

Una nueva tecnología que permite evaluar las interacciones en tres dimensiones entre diferentes partes del genoma ha desvelado cómo están estas moléculas en un espacio tan diminuto. Los resultados podrían dar lugar también a nuevas pistas sobre la regulación del genoma: cómo se activan y desactivan genes específicos.

Aunque anteriormente los científicos han sido capaces de resolver la estructura tridimensional de las partes del genoma, este nuevo estudio es el primero en hacerlo en la escala del ancho del genoma. "Nuestra tecnología es una especie de IRM para genomas", señala Erez Lieberman-Aiden, investigador de la Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology y uno de los autores de un nuevo artículo que detalla el trabajo.

El ADN tiene múltiples niveles de organización: la secuencia lineal de bases, su famosa estructural helicoidal y formaciones de orden superior que lo envuelven alrededor de la proteínas y lo enrollan para formar los cromosomas; pero identificar cómo está organizado el ADN en estos niveles superiores a lo largo del genoma ha sido complicado. "Tenemos la secuencia lineal completa del genoma, pero nadie sabe siquiera los principios de cómo está organizado el ADN en el espacio de orden superior", señala Tom Misteli, científico del National Cancer Institute, de Bethesda, Maryland, quien no participó en el estudio.
Fuente: Technology Review

[Version English]

Unfolded, the human genome was about six feet of DNA. Surprisingly, all that is rolled over in the nucleus of a cell of about three micrometers in diameter, about one third the width of a human hair.


A new technology that allows to evaluate three-dimensional interactions between different parts of the genome has revealed how these molecules are so tiny a space. The results could also lead to new insights into the regulation of the genome: how to activate and deactivate specific genes.


Although scientists have previously been able to solve the three dimensional structure of the parts of the genome, this new study is the first to do so in the genome wide scale. "Our technology is a kind of MRI to genomes," says Erez Lieberman, Aiden, a researcher at the Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology and one of the authors of a new article detailing the work.


DNA has multiple levels of organization: the linear sequence of bases, his famous helical structural and higher order formations that wrapped around the protein and wound into chromosomes, but identify how DNA is organized into these higher levels to throughout the genome has been difficult. "We have the linear sequence the genome, but no one even knows the principles of how DNA is organized into higher-order space," says Tom Misteli, scientist at the National Cancer Institute, Bethesda, Maryland, who was not involved in the study.

Source: Technology Review